공과대학

학위

• 박사, 충남대학교 컴퓨터공학과 (세부전공 : 생물정보학/인공지능), 200308
• 석사, 경북대학교 미생물학과 (세부전공 : 생물정보학), 199702
• 학사, 경북대학교 미생물학과 (세부전공 : 미생물/분자생물), 199202

경력

• 학술간사, 한국생명과학회 , (2006.01~ )

논문

• miRHunter: A Tool for Predicting microRNA Precursors Based on Combined Computational Method, BIOCHIP JOURNAL, 201706
• Next Generation Sequencing and Bioinformatics, 생명과학회지, 201503
• A Survey on Computational Approaches to the Discovery of microRNA Genes, CURRENT BIOINFORMATICS, 201404
• miRTar Hunter: A prediction system for identifying human microRNA target sites, MOLECULES AND CELLS, 201303
• Web-based computational system for protein-protein interaction inference, Journal of Information Processing Systems, 201203
• PromoterWizard: An Integrated Promoter Prediction Program Using Hybrid Methods, Genomics & Informatics, 201112
• Bioinformatics : Latest Application and Interdisciplinary Field of Computer Science, 한국산학기술학회논문지, 201003
• CpG Islands Detector: a Window-based CpG Island Search Tool, Genomics & Informatics, 201003
• 공개용 리소스를 활용한 Haplotype 재조합 시스템 개발, 한국산학기술학회논문지, 201002
• ORF Miner: a Web-based ORF Search Tool, Genomics & Informatics, 20091231
• Computational Approach for the Analysis of Post-PKS Glycosylation Step, Genomics & Informatics, 20081231
• Computational Approach for Biosynthetic Engineering of Post-PKS Tailoring Enzymes, Genomics & Informatics, 20081231
• 프로모터 영역의 전사인자 결합부위 Consensus 패턴 탐색 방법, 한국산학기술학회논문지, 20081016
• CpG Island 검색용 윈도우 프로그램 개발, 생명과학회지, 20080829
• 단백질 상호작용 데이터의 효율적 관리와 자동 갱신을 위한 시스템 설계와 구현, 생명과학회지, 20080331
• Predicting the Interactome of Xanthomonas oryzae pathovar oryzae for target selection and DB service, BMC Bioinformatics, 20080124
• 유전자 프로모터 예측을 위한 Support Vector Machine의 응용 방법에 대한 연, 생명과학회지, 20070525
• Computational Detection of Prokaryotic Core Promoters in Genomic Sequences, The Journal of Microbiology, 200510
• SNP 유전형의 결측치 처리를 위한 연관불균형 기반의 대치법, 공학기술연구소, 200502
• 미생물 유전체 주석을 위한 유전자 온톨로지 분석 및 분류 도구들, 공학기술연구소, 200502
• 웹 기반의 단백질 상호작용 및 기능 분석을 위한 보조 시스템 개발, 생명과학회지, 200412
• 모티프 및 도메인 검색을 위한 통합 시스템 개발, 생명과학회지, 200412
• 단백질 상호작용 및 가시화 시스템, 정보과학회논문지, 200412
• Composite Dependency-reflecting Model for Core Promoter Recognition in Vertebrate Genomic DNA Sequences, Journal of Biochemistry & Molecular Biology, 200411
• SNP 유전자 데이터 처리를 위한 반수체형 대치법, 교수논문집, 200411
• 미생물 유전체 프로젝트를 위한 통합 데이터 관리 시스템, 교수논문집, 200411
• 단백질 상호작용 데이터의 효율적 관리와 자동 갱신을 위한 시스템 디자인과 구현, 교수논문집, 200405
• 단말기 식별자 기반 생성 키를 활용하는 브로드캐스트 암호화 시스템, 교수논문집, 200405
• Support Vector Machine을 이용한 유전자 프로모터 영역 예측, 교수논문집, 200405
• 웹 서비스 환경 구축에 의한 대사경로 데이터베이스 통합 활용, 교수논문집, 200405
• 유전체 서열에 대한 기능 분석 시스템 개발, 교수논문집, 200312
• 도메인 및 모티프 검색을 이용한 유전자 기능 분석 시스템 개발, 교수 논문집, 200312
• 유전체 염기서열 상에서의 단백질 코딩 영역 예측 프로그램 개발, 교수 논문집, 200312
• 단백질 상호작용 데이터베이스들을 이용한 단백질 기능 분석 전략에 대한 연구, 교수 논문집, 200312
• 유전자 알고리즘을 이용한 프로모터 영역의 전사인자 결합부위 패턴 탐색, 정보과학회논문지(A.B.C), 200306
• 의존성 반영 분해모델에 의한 유전자의 핵심 프로모터 영역 예측, 정보처리학회논문지A,B,C,D, 200304
• A Method for Identifying Splice Sites and Translation Start Sites in Human Genomic Sequences, Journal of Biochemistry and Molecular Biology - 등재, 200209

지식재산

• 프로그램명: ConPath, 20010904
• 프로그램명: RetPro, 20010904
• 프로그램명: ChroView, 20010904
• 프로그램명: ConView, 20010904
• 프로그램명: GPMan, 20010904
• 프로그램명: AnnoView, 20010904

학술발표

• A Computational Prediction System for Identifying Human microRNA Target Sites, Mathematical Biosciences Institute, 20140827
• A Computational Approach for Identifying miRNA-Target Interactions Using Dynamic Programming, the Frontiers of InformFITAT/ISPM, 20130926
• A Computational Prediction System for Identifying Human microRNA Target Sites, RECOMB, 20130408
• TargetDetector: a miRNA Target Prediction Tool, Korean Society for Bioinformatics and Systems Biology (KSBSB), 20111205
• Development of a MicroRNA Target Prediction Tool, (사)한국생명과학회, 20111027
• Computational Approach for the Analysis of Post-PKS Glycosylation, (사)한국응용생명화학회, 20111020
• Visualizing Cell Biology, Broad Institute, 20110420
• Computational Analysis System for Nuclear Hormone receptors Based on Liver-Sepecific Expression Data, The BIO5 Institute, 20090520
• Microbial Genome-based Analysis System for Post-PKS Tailoring steps, SELECT BIOSCIENCES, 20090224
• Computational System for Inferring Protein-Protein Interactions, 한국분자세포생물학회, 20090205
• Introduction to the analysis system for post-PKS tailoring steps, 한국유전체학회, 20090116
• 폴리케타이드 당 단일체 생합성 분석 시스템 개발 , 대한의료정보학회, 20081121
• Computational Analysis System for Nuclear Hormone Receptors Based on Liver-Specific Expression Gene Database, 한국생물정보시스템생물학회, 20081114
• Development of Analysis System for Post-PKS Tailoring Enzymes, 한국응용생명화학회, 20081024
• Computational System for the Analysis of Post-PKS Glycosylation Step , 한국생명과학회, 20081010
• Development of Analysis System for Post-PKS Tailoring Steps, International Society for Computational Biology, 20080721
• Computational Approaches to the Post-PKS Modification, 한국생명과학회, 20071005
• Computational Approaches to the Glycosylation in the Post-PKS Tailoring Steps, ISCB/EBI, 20070723
• Computational Approaches to the Prediction of Deoxysugar Pathways in the Post-PKS Tailoring Steps, 한국미생물학회, 20070510
• Development of CpG Island Search Tool, 한국생명과학회, 200609
• Development of a Hybrid Method to Predict Promoters in Vertebrate Genomic DNA Sequences, 한국생물정보학회, 200609
• Hybrid Computational Method for Pol II Promoter Detection, ISCB (International Society for Computational Biology), 200407
• WASPIV: Web-based Assistant System for PPI (Protein-protein interaction) Inference and Validation, International Society for Computational Biology, 200407
• Protein-protein Interaction Inference System for Protein Function Prediction, 한국미생물 생명공학회, 200406
• 상호작용 및 도메인 정보를 이용한 단백질 기능 분석 시스템, 한국정보과학회, 200404
• 단백질 기능분석을 위한 생물학 데이터베이스 활용 전략, 한국데이터베이스진흥센터, 한국데이터베이스학회, 전자신문사, 200311

수상

• 우수발표 논문상, 정보과학회논문지, 20041022